В России обнаружен штамм «омикрон». Ждать ли подъем волны COVID-19
- Как «омикрон» попал в Россию
- Где и как распространяется «омикрон»
- Новая волна в ЮАР и происхождение омикрон-штамма
© REUTERS / Jeenah MoonЧитать ria.ru в У двоих россиян, вернувшихся из ЮАР, выявили «омикрон», сообщает Роспотребнадзор. Новый вариант коронавируса с многочисленными мутациями в самом значимом участке генома обнаружили в конце ноября в странах Южной Африки. Он быстро распространяется и, полагают эксперты, способен породить очередную волну пандемии.Как «омикрон» попал в РоссиюВ пятницу, 4 декабря, в Домодедово приземлился самолет с 170 россиянами на борту, вывезенными из ЮАР и Намибии. Из-за вспышки COVID-19, вызванной «омикроном», авиасообщение с этим регионом прервали. Все прибывшие отправились на двухнедельный карантин в обсерватор в Сергиевом Посаде.У троих пассажиров — кашель, температура, боль в горле. Среди них писательница Юлия Демина из Ярославля. Как сообщает RT, ПЦР у нее положительный. Врачи сказали, что это «омикрон». Ее и еще одну семейную пару перевезли в другой обсерватор, в поселке Запрудня на юге Московской области.В понедельник, 6 декабря, Роспотребнадзор подтвердил, что у двоих прилетевших из ЮАР россиян «омикрон». Всего положительных тестов пока десять.Таким образом, Россия попала в список из 38 стран с этим гипермутантом. В данный момент в мире доминирует дельта-штамм, утверждают в ВОЗ. Однако ситуация может быстро измениться.Где и как распространяется «омикрон»О новом варианте коронавируса сообщили 24 ноября ученые из ЮАР, выборочно расшифровывавшие геномы возбудителей COVID-19 в округе Цване столичной провинции Гаутенг. Там среди студентов Университета Претории произошла вспышка инфекции, и нужно было выяснить, в чем причина.Сразу обратили внимание на огромное число мутаций у изолята по сравнению с исходным уханьским штаммом — 53. Из них 30 в спайк-белке, что вызывало большое беспокойство. Это могло означать, что вирус стал более заразным.Геном опубликовали в открытой базе GISAID, ВОЗ включила его в список вызывающих озабоченность штаммов (здесь и далее этот термин означает «вариант»). Ему присвоили собственный идентификатор — B.1.1.52, а позже название линии — «омикрон».
4 декабря, 08:00НаукаУскользает от иммунитета. Ученые раскрыли свойства омикрон-штамма COVID-19 До сих пор все известные заражения «омикроном» за пределами Южной Африки — завозные. Причем в некоторых странах он вызвал вспышки в результате событий суперраспространения, что косвенно свидетельствует о его большей заразности и умении обходить приобретенный иммунитет, в том числе вакцинный. Так, в столице Норвегии Осло после корпоративной вечеринки компании Scatec из 120 гостей заболели более ста, в том числе посетители бара, расположенного этажом ниже. У 13-ти подтвердился «омикрон»: на корпоративе были сотрудники, вернувшиеся из ЮАР.В Дании, в Виборге, новым вариантом патогена после вечеринки для старшеклассников заразились 53 человека. Всего в королевстве 183 инфицированных «омикроном».В США он уже в нескольких штатах, причем многие заболевшие участвовали в конференции любителей аниме в конце ноября в Нью-Йорке. Первым вирус выявили у побывавшего там жителя Миннесоты, теперь тестируют все 53 тысячи человек.В Великобритании число инфицированных «омикроном» удваивается каждые три дня. Возможно, дело в большом количестве ПЦР-тестов, отмечает генетик Дмитрий Прусс. «Но в первом приближении это может означать, что и более высокий уровень вакцинации и ревакцинации в Британии не может затормозить «омикрон», — указал эксперт в фейсбуке.Все эти вспышки происходят в странах, где привито большинство населения, на ковид-фри мероприятиях. Сообщают о легких симптомах, которые быстро проходят. Это послужило основанием для разговоров о том, что «омикрон» эволюционировал в сторону меньшей патогенности, стал безвреден. Однако эксперты не спешат с выводами и ждут данные из ЮАР, где вакцинирована всего четверть населения.Новая волна в ЮАР и происхождение омикрон-штаммаСамые острые вопросы сейчас: насколько серьезное заболевание вызывает «омикрон», опаснее ли он других вариантов, в частности «дельты». Первые данные об этом публикует Южноафриканский медицинский исследовательский совет.За две недели — с 14 по 29 ноября — в клинике Стива Бико в центре округа Цване наблюдали 166 пациентов с подтвержденным коронавирусом. Причем, подчеркивают авторы отчета, у большинства инфекцию выявили попутно: в больницу они попали из-за других недугов. Ковидная пневмония возникла у девятерых (все не вакцинированы), только один оказался в реанимации (вакцинирован, но у него хроническая обструктивная болезнь легких), еще четверым потребовалось интенсивное лечение. Десять человек умерли, однако неясно, связано ли это с ковидом.© ИнфографикаШтаммы «омикрон» и «дельта»: мутации S-белкаУченые перечисляют ключевые индикаторы опасности болезни: смертность, число нуждающихся в кислородной поддержке, реанимации, длительность госпитализации. По этим критериям пока ситуация выглядит неплохо, но медики советуют не слишком обольщаться. «Профиль пациентов может резко измениться по мере поступления данных в следующие две недели. Тогда и сделаем более точные выводы», — констатируют они.Аналитик Александр Драган указывает на многочисленные нестыковки в отчете из одного-единственного госпиталя, которые не позволяют делать оптимистичные выводы. Однако кое-что из него можно извлечь. «Есть бессимптомные носители. «Омикрон» протекает в разных формах: от легкой до тяжелой. Люди не умирают и не утяжеляются сразу. В то же время это вовсе не безобидная простуда», — рассуждает эксперт.Подъем четвертой волны COVID-19 в ЮАР связывают именно с «омикроном». Эпицентр — в округе Цване. Заболеваемость там в последние недели растет по экспоненте.© Fareed AbdullahДанные из округа Цване в ЮАР — эпицентра вспышки, вызванной омикрон-штаммомУченые пока не берутся давать прогнозы. Если «омикрон» вытеснит «дельту», это хорошо, поделился мнением в фейсбуке генетик Алексей Кондрашов. В таком случае, по его словам: «Первое. И против «омикрона» нынешние вакцины должны неплохо работать. Второе. Видообразования вируса пока не произошло». Худший сценарий — если появится несколько разновидностей возбудителей ковида. «Против каждого надо отдельно прививаться, и каждый независимо эволюционирует куда-нибудь», — поясняет специалист.Весьма обстоятельный анализ представили (в виде препринта) 5 декабря биоинформатики из ЮАР, открывшие «омикрон».
Они исследовали изменения в спайк-белке и обнаружили три кластера мутаций, включающие 13 аминокислот из очень консервативных участков. В подсемействе коронавирусов, к которому принадлежит SARS-CoV-2, раньше их не было. По мнению ученых, эти мутации неслучайны, они позволяют вирусу быстрее распространяться и обходить вируснейтрализующие антитела, сформированные инфекцией. Так вирус адаптировался. Однако где и как он возник, неизвестно. Есть три гипотезы. Возможно, его просто пропустили, потому что с мая по сентябрь в Южной Африке мало тестировали. Или он эволюционировал в хронически больном ковидом человеке или группе людей. Такое не исключено, в частности, у пациентов с ослабленной иммунной системой. Третий путь — обратный перескок от каких-то животных. Они заразились от человека в пандемию, вирус в них мутировал и снова вернулся к человеку.© Иллюстрация РИА НовостиЭволюция вируса SARS-CoV-2
